May 31, 2023
Le meilleur ami de l'homme
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Le domaine de l'oncologie humaine a réalisé des progrès significatifs ces dernières années, grâce au projet Génome humain et aux nombreux ensembles de données générés par le consortium Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE). Des niveaux similaires de données spécifiques aux chiens seront essentiels pour permettre des stratégies de médecine comparée, car les tumeurs des chiens domestiques présentent un grand potentiel en tant que modèles de cancer naturels et précieux dans la recherche translationnelle. Cet article explique comment la culture de lignées organoïdes canines peut être utilisée pour faire des observations significatives dans le domaine émergent de l’oncologie comparative, provoquant ainsi la prochaine révolution dans les études sur le cancer animal et humain.
Les tumeurs canines constituent un excellent modèle comparatif en oncologie en raison de leur apparition spontanée, de leur similitude avec les tumeurs humaines et de leurs expositions environnementales partagées. Les chiens et les humains peuvent être exposés à des facteurs externes similaires – notamment des toxines, des virus et la pollution – qui peuvent entraîner des altérations épigénétiques, des changements métaboliques et des changements liés au système immunitaire, susceptibles de provoquer le cancer chez les deux espèces. Les recherches portant sur les masses incontrôlées chez les animaux de compagnie peuvent révéler les complexités de la pathogenèse du cancer chez les animaux et chez les humains.
Le domaine de la recherche sur le cancer humain a été transformé par la richesse des données de séquençage de nouvelle génération (NGS), mais la médecine vétérinaire manque d'un volume équivalent de données spécifiques aux chiens. Pour combler cette lacune, le Cho Lab du Collège de médecine vétérinaire de l'Université nationale de Séoul a entrepris un travail pionnier dans la cartographie de l'épigénome du chien domestique.1 Ce travail comprend des études épigénomiques qui examinent les modifications chimiques de l'ADN et des protéines histones qui peuvent influencent l’expression des gènes, mettant en lumière la régulation des gènes liés au cancer. La recherche contribue à débloquer des informations précieuses pour faire progresser notre compréhension de l’oncologie comparative en élargissant la disponibilité des ensembles de données NGS canins, et ces données sont désormais utilisées pour étudier la biologie du cancer à l’aide d’organoïdes.
Les cultures organoïdes tridimensionnelles sont apparues comme un outil puissant pour étudier le développement du cancer et la réponse au traitement, imitant fidèlement l’architecture et la fonctionnalité d’organes réels. Les organoïdes dérivés de chiens provenant de modèles de tumeurs présentent des similitudes remarquables avec leurs homologues humains, notamment des caractéristiques histologiques, des modèles d'expression génique et des réponses aux agents thérapeutiques. Des organoïdes provenant de divers types d’échantillons de tumeurs peuvent être cultivés, notamment des tumeurs des glandes mammaires, des ostéosarcomes et des mélanomes. Ces cultures organoïdes dérivées de chiens peuvent être utilisées pour évaluer l’efficacité de divers traitements et identifier des biomarqueurs potentiels, fournissant ainsi des données primaires vitales pour la comparaison avec les organoïdes humains. L’évaluation de plusieurs options de traitement de cette manière offre une opportunité précieuse d’optimiser les stratégies thérapeutiques avant les essais cliniques sur des patients humains.
Les organoïdes sont des structures cellulaires délicates qui nécessitent une manipulation douce pour éviter toute perte d’échantillon. L'aspiration est une étape fréquemment répétée tout au long de la recherche organoïde pour la maintenance de la culture, l'extraction d'échantillons et la préparation de la bibliothèque NGS. Le Cho Lab s'appuie sur le système d'aspiration sécurisé VACUSAFE et le système d'aspiration portable VACUSIP d'INTEGRA Biosciences pour améliorer le contrôle des activités d'aspiration par rapport aux alternatives traditionnelles (Figure 1). La fonction de valve activée par le doigt du système VACUSAFE d'INTEGRA permet un contrôle sensible du débit d'aspiration, avec un choix de différentes intensités de vide pour améliorer encore la manipulation douce des organoïdes précieux. De plus, le système d'aspiration VACUSIP léger et portable d'INTEGRA permet un confort et une flexibilité maximum dans tout le laboratoire, ce qui le rend idéal à la fois pour la maintenance des cultures cellulaires et pour les flux de travail NGS.